LA INDEPENDENCIA Además de la dominancia y de la segregación, Mendel descubrió en sus guisantes otro hecho importante. Hasta ahora sólo teníamos en cuenta un solo par de caracteres antagónicos, semillas amarillas y semillas verdes. Pero Mendel cruzó también guisantes de semillas amarillas y lisas con guisantes de semillas verdes y rugosas, para ver si el carácter "amarillo" y el carácter "liso", coexistentes en uno de los padres, estaban ligados uno a otro o podían separarse.
Cruzamiento de guisantes de semilla lisa y amarilla con guisantes de semilla rugosa y verde. En la primera generación F1 todas son lisas y amarillas. En F2 la segregación independiente da no sólo semillas iguales a los padres, sino también las nuevas combinaciones: "amarilla rugosa" y "lisa verde".
En F1 todos los individuos serán "amarillos" y "lisos", quedando claro que "liso" domina a "rugoso", como "amarillo" domina a "verde". Autofecundando estos híbridos, Mendel obtuvo en F2 individuos "amarillos lisos" y "verdes rugosos", como los padres; pero también obtuvo "amarillos rugosos" y "verdes lisos", lo que mostró que "amarillo" no estaba ligado a "liso", ni "verde" a "rugoso". La explicación de esa segregación independiente es simple. Designemos con las iniciales L y r los genes que producen respectivamente el carácter dominante "semilla lisa" y el carácter recesivo "semilla rugosa", y llamemos A y v a los genes para "semilla amarilla" (dominante), y "semilla verde" (recesiva). Un híbrido de F1, "amarillo y liso", contiene no sólo los genes A y L, sino también sus antagónicos recesivos v y r. ¿Dónde están localizados estos genes? En cierto cromosoma está A y en otro cromosoma del mismo par está v, L y r, ya que son antagónicos, están también en un mismo par de cromosomas, cada cual en uno de ellos. Pero el par de cromosomas que contiene A y v no es el mismo que contiene L y r. Si A y L estuvieran en el mismo cromosoma, como el cromosoma pasa íntegro a los gametos, y de éstos a la célula huevo, donde estuviese el gen A estaría también L. De esta manera Mendel no hubiera podido obtener individuos de semillas amarillas que no fuesen lisas, como obtuvo.
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